ОХНМЖурнал физической химии Russian Journal of Physical Chemistry

  • ISSN (Print) 0044-4537
  • ISSN (Online) 3034-5537

КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ АРОМАТИЧЕСКИХ АМИНОКИСЛОТ И СОРБЕНТОВ

Код статьи
S3034553725090082-1
DOI
10.7868/S3034553725090082
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 99 / Номер выпуска 9
Страницы
1352-1359
Аннотация
Рассмотрены результаты квантово-химического моделирования межмолекулярных взаимодействий между гидрофобными аминокислотами (фенилаланин и триптофан) и ароматическим элементом матрицы сорбента, основной вклад в которые вносят π–π-взаимодействия. Установлено, что для обеих аминокислот реализуются параллельное и Т-образное расположение ароматических структур аминокислоты и сорбента друг относительно друга. Для триптофана, помимо этого, реализуется Т-вариант расположения с ориентацией гетероатома радикала аминокислоты к кольцу матрицы сорбента. Рассмотрены результаты квантово-химического моделирования формирования второго сорбционного слоя в сорбенте за счет π–π-взаимодействий. Проведен анализ энергии и геометрических характеристик в указанных системах.
Ключевые слова
π–π-взаимодействие квантово-химическое моделирование фенилаланин триптофан
Дата публикации
13.03.2026
Год выхода
2026
Всего подписок
0
Всего просмотров
33

Библиография

  1. 1. Пчелин В.А. Гидрофобные взаимодействия в дисперсных системах. М.: Знание, 1976. 64 с.
  2. 2. Яминский В.В., Пчелин В.А., Амелина Е.А., Шукин Е.Д. Коагуляционные контакты в дисперсных системах. М.: Химия, 1982. 185 с.
  3. 3. Meyer E.E., Rosenberg K.J., Israelachvili J. // Biophysics and Computational Biology. 2006. V. 103. № 43. P. 15739. https://doi.org/10.1073/pnas.0606422103
  4. 4. Hunter C.A., Sanders J.R.M. // J. Am. Chem. Soc. 1990. V. 112. № 14. P. 5525. https://doi.org/10.1021/ja00170a016
  5. 5. Meyer E.A., Castellano R.K., Diederich F. // Angew Chem Int Ed Engl. 2003. V. 42. № 11. P. 1210. https://doi.org/10.1002/anie.200390319
  6. 6. Martinez C.R., Iverson B.L. // Chemical Science. 2012. V.3. № 7. P. 2191. https://doi.org/10.1039/c2sc20045g
  7. 7. Akher F.B., Ebrahimi A., Mostafavi N. // J. Mol. Struct. 2017. V. 1128. P. 13. http://dx.doi.org/10.1016/j.molstruc.2016.08.040
  8. 8. Tsuzuki S., Honda K., Uchimaru T. et al. // J. Am. Chem. Soc. 2002 V. 124. № 1. P. 104. https://doi.org/10.1021/ja0105212
  9. 9. Мухина Ю.В. // Актуальные вопросы биологической физики и химии 2018. Т. 3. № 2. С. 320.
  10. 10. McGaughey G.B., Gagnép M., Rappé A.K. // J. of Biological Chem. 1998. V. 273. № 25. P. 15458. https://doi.org/10.1074/jbc.273.25.15458
  11. 11. Vasil’eva V.I., Goleva E.A., Selemenev V.F. et al. // Russ. J. Phys. Chem. А. 2019. Т. 93. № 3. С. 542. @@ Васильева В.И., Голева Е.А., Селеменев В.Ф. и др. // Журн. физ. химии. 2019. Т. 93. № 3. С. 428. https://doi.org/10.1134/S0044453719030221
  12. 12. Селеменев В.Ф., Чиканов В.Н., Фрелих П. и др. // Журн. физ. химии. 1990. Т. 64. № 12. С. 1555.
  13. 13. ТОКЕМ. https://td-uhk.ru/catalog/
  14. 14. Purolite Resins Product Guide // www.puroliteresins.com /dam/jcr: bb4577ce‑96f9-4756-a629-bc7013331367/product-summary-guide-english.pdf
  15. 15. Демин А.А., Чернова И.А., Шатаева Л.К. Ионообменная сорбция биологически активных веществ. СПб.: Изд-во С.-Петерб. ун-та, 2008. 154 с.
  16. 16. Селеменев В.Ф., Хохлов В.Ю., Бобрешова О.В. и др. Физико-химические основы сорбционных и мембранных методов выделения и разделения аминокислот. Воронеж: Изд-во Воронеж. ун-та, 2001. 299 с.
  17. 17. Judith K., Reinhold C., Dietmar R.K. // J. Agric. Food Chem. 2011. V. 59. № 1. P. 22. https://doi.org/10.1021/jf1032203
  18. 18. Даванков В.А., Цурюпа М.П. Сверхсшитые полистирольные сорбенты. Германия: Palmarium Academic Publishing, 2012. 76 с.
  19. 19. Цюрупа М.П., Блинникова З.К., Павлова Л.А. и др. // Лаборатория и производство. 2020. Т. 1. № 11. С. 86. doi: 10.32757/2619-0923.2020.1.11.86.96
  20. 20. Трунаева Е.С., Хохлова О.Н., Хохлов В.Ю. // Сорбц. и хромат. процессы. 2018. Т. 18. № 2. С. 142. https://doi.org/10.17308/sorpchrom.2018.18/493
  21. 21. Khokhlova O.N., Kashirtseva E.R., Khokhlov V.Yu. et al. // Russ. J. Phys. Chem. А. 2021. V. 95. P. 762. @@ Хохлова О.Н., Каширцева Е.Р., Хохлов В.Ю. и др. // Журн. физ. химии. 2021. Т. 95. № 4. С. 581. https://doi.org/10.1134/S0036024421040130
  22. 22. Frisch M.J., Trucks G.W., Schlegel H.B., Scuseria G.E., Robb M.A., Cheeseman J.R., Scalmani G., Barone V., Mennucci B., Petersson G.A., Nakatsuji H., Caricato M., Li X., Hratchian H.P., Izmaylov A.F., Bloino J., Zheng G., Sonnenberg J.L., Hada M., Ehara M., Toyota K., Fukuda R., Hasegawa J., Ishida M., Nakajima T., Honda Y., Kitao O., Nakai H., Vreven T., Montgomery J.A., Jr., Peralta J.E., Ogliaro F., Bearpark M., Heyd J.J., Brothers E., Kudin K.N., Staroverov V.N., Kobayashi R., Normand J., Raghavachari K., Rendell A., Burant J.C., Iyengar S.S., Tomasi J., Cossi M., Rega N., Millam J.M., Klene M., Knox J.E., Cross J.B., Bakken V., Adamo C., Jaramillo J., Gomperts R., Stratmann R.E., Yazyev O., Austin A.J., Cammi R., Pomelli C., Ochterski J.W., Martin R.L., Morokuma K., Zakrzewski V.G., Voth G.A., Salvador P., Dannenberg J.J., Dapprich S., Daniels A.D., Farkas Ö., Foresman J.B., Ortiz J.V., Cioslowski J., and Fox D.J. Gaussian, Inc. Gaussian 09. Rev. D.01.Wallingford CT, 2016.
  23. 23. Huber R.G., Margreiter M.A., Fuchs J.E. et al. // J. Chem. Inf. Model. 2014. V. 54. № 5. P. 1371. https://doi.org/10.1021/ci500183u
  24. 24. Waller M.P., Robertazzi A., Platts J.A. et al. // J. Comput Chem. 2006. V. 27. № 4. P. 491. https://doi.org/10.1002/jcc.20363
  25. 25. Trunaeva E.S., Khokhlova O.N., Khokhlov V. Yu. // J. Struct Chem. 2015. № 6. @@ Трунаева Е.С., Хохлова О.Н., Хохлов В.Ю. // Журн. структ. хим. 2015. Т. 56. № 6. С. 1111. DOI: 10.15372/JSC20150605
  26. 26. Нечаева Л.С., Бутырская Е.В., Запрягаев С.А. // Журн. структур. химии. 2017. Т. 58. № 2. С. 233. doi: 10.15372/JSC20170201
  27. 27. Ehrlich S., Moellmann J., Grimme S. // Acc. Chem. Res. 2013. V. 46. № 4. P. 916. https://doi.org/10.1021/ar3000844
  28. 28. Zhao Y., Li J., Gu H. et al. // Interdiscip Sci Comput Life Sci. 2015. V. 7. P. 211. https://doi.org/10.1007/s12539-015-0263-z
  29. 29. McCoy V.R. Chong P.A., Tsang B. et al. // eLife. 2018. https://doi.org/10.7554/eLife.31486
  30. 30. Janiak C. // J. Chem. Soc. 2000. V. 21. P. 3885. https://doi.org/10.1039/B003010O
  31. 31. Хохлова О.Н., Трошина П.В., Быковская А.С. и др. // Сорбц. и хромат. процессы. 2021. Т. 21. № 4. С. 486. https://doi.org/10.17308/sorpchrom.2021.21/3632
  32. 32. Хохлова О.Н. // Вестник ВГУ. Серия: Химия. Биология. Фармация. 2015. № 2. С. 42.
  33. 33. Khokhlova O.N. // Russ. J. Phys. Chem. А. 2019. Т. 93. № 1. С. 1. [Хохлова О.Н. // Журн. физ. химии. 2019. Т. 93. № 1. С. 5. doi: 10.1134/S00444537190101511]
  34. 34. Yan Yao, Abraham M Lenhoff // J. Chromatogr A. 2006. V. 1126. I. 1–2. P. 107. doi: 10.1016/j.chroma.2006.06.057
  35. 35. Kun K.A., Kunin R. // J. of Polymer Science Part C: Polymer Symposia. 1967. V. 16. № 3. P. 1457. https://doi.org/10.1002/polc.5070160323
  36. 36. Селеменев В.Ф., Хохлов В.Ю., Матвеева М.В. и др. // Журн. физ. химии. 1996. Т. 70. № 2. С. 370.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека